Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SACSQ9NZJ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms