Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD8Q9NX08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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