Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMLHEQ9NVH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMLHEQ9NVH6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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