Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPRD1BQ9NQG5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPRD1BQ9NQG5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms