Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR41Q9HAD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms