Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK3Q9H422 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK3Q9H422 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms