Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6CQ9H3T2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms