Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIFKQ9BYG3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms