Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC94Q9BW85 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms