Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF1Q99551 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTERF1Q99551 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms