Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDF2Q99470 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDF2Q99470 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SDF2Q99470 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDF2Q99470 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDF2Q99470 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms