Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC43Q96MW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms