Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPL1Q96JK4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HHIPL1Q96JK4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HHIPL1Q96JK4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms