Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLUAP1Q96AJ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms