Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR2Q969E8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms