Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP33Q8TEY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP33Q8TEY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms