Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNERQ8NFT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNERQ8NFT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNERQ8NFT8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms