Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms