Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms