Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L3Q6VB84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms