Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC137Q6PK04 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms