Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD1Q658N2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD1Q658N2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms