Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF19Q5T6S3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF19Q5T6S3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.6 ms