Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOHLH1Q5JUK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms