Protein–RNA interactions for Protein: Q5BVD1

TTMP, TPA-induced transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTMPQ5BVD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTMPQ5BVD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTMPQ5BVD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms