Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT12Q53H54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms