Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODF4Q2M2E3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms