Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RRN3P1Q2M238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RRN3P1Q2M238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RRN3P1Q2M238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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