Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK2Q16620 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK2Q16620 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK2Q16620 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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