Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARB2Q14108 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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