Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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