Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED1Q13445 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED1Q13445 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TMED1Q13445 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TMED1Q13445 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TMED1Q13445 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TMED1Q13445 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED1Q13445 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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