Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF3Q12996 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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