Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SREBF2Q12772 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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