Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPIRE1Q08AE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms