Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD1Q02809 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms