Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113P62684 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERVK_113P62684 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms