Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1CAP62136 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms