Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBEYP58557 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBEYP58557 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBEYP58557 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBEYP58557 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBEYP58557 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBEYP58557 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBEYP58557 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBEYP58557 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBEYP58557 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBEYP58557 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBEYP58557 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBEYP58557 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YBEYP58557 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBEYP58557 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBEYP58557 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBEYP58557 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms