Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD23AP54725 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23AP54725 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23AP54725 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23AP54725 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23AP54725 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms