Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2C2P49116 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2C2P49116 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms