Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SRV2	YNL138W	1581 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	TEL2	YGR099W	2067 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	HRR25	YPL204W	1485 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	HOS1	YPR068C	1413 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	TRX2	YGR209C	315 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	CTR2	YHR175W	570 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	ATG17	YLR423C	1254 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YPL191C	YPL191C	1083 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	TDA6	YPR157W	1404 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	NOP7	YGR103W	1818 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	TKL1	YPR074C	2043 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YLF2	YHL014C	1218 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	BUB3	YOR026W	1026 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	NPL6	YMR091C	1308 nt		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	CRZ1	YNL027W	2037 nt		4.9	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	PDR10	YOR328W	4695 nt		4.9	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	APS1	YLR170C	471 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	CCS1	YMR038C	750 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	MDG1	YNL173C	1101 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	UBP9	YER098W	2265 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	EIS1	YMR031C	2532 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YJR124C	YJR124C	1347 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	FOB1	YDR110W	1701 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	MMT2	YPL224C	1455 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	AUA1	YFL010W-A	285 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	DOM34	YNL001W	1161 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PPG1	YNR032W	1107 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	SLD7	YOR060C	774 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	TRS33	YOR115C	807 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PDB1	YBR221C	1101 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	NOP2	YNL061W	1857 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	SAF1	YBR280C	1914 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	GUS1	YGL245W	2127 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YJL206C	YJL206C	2277 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	CAB1	YDR531W	1104 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	HSP31	YDR533C	714 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	COX17	YLL009C	210 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	snR17b	snR17b	332 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	UBA3	YPR066W	900 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	CDC28	YBR160W	897 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	NTH2	YBR001C	2343 nt		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	RCK1	YGL158W	1539 nt		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YNL174W	YNL174W	573 nt		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	ATG23	YLR431C	1362 nt		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	GUP2	YPL189W	1830 nt		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	FAT3	YKL187C	2253 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YML131W	YML131W	1098 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PEP4	YPL154C	1218 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	COX18	YGR062C	951 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	ARP1	YHR129C	1155 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	REV7	YIL139C	738 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	SOL1	YNR034W	966 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	PEX32	YBR168W	1242 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	P38316	RDL1	YOR285W	420 nt		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SIF2	YBR103W	1608 nt		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	FHL1	YPR104C	2811 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SEC17	YBL050W	879 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	AIF1	YNR074C	1137 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	TIF5	YPR041W	1218 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	LPL1	YOR059C	1353 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	CCZ1	YBR131W	2115 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YHR145C	YHR145C	357 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	MVD1	YNR043W	1191 nt		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	CNM67	YNL225C	1746 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	MET7	YOR241W	1647 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	RPN6	YDL097C	1305 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	RBA50	YDR527W	1320 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	TAH18	YPR048W	1872 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	MDY2	YOL111C	639 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.8	□□□□□ -1.64

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