Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5A1P25705 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms