Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A1P20849 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL9A1P20849 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A1P20849 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms