Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD58P19256 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD58P19256 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CD58P19256 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD58P19256 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD58P19256 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD58P19256 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CD58P19256 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD58P19256 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD58P19256 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD58P19256 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD58P19256 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD58P19256 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD58P19256 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD58P19256 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD58P19256 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD58P19256 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD58P19256 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD58P19256 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD58P19256 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD58P19256 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD58P19256 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD58P19256 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.1 ms