Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF28P17035 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF28P17035 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF28P17035 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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