Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFXP16104 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms