Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFLP07196 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFLP07196 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFLP07196 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEFLP07196 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEFLP07196 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFLP07196 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFLP07196 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFLP07196 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFLP07196 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFLP07196 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFLP07196 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFLP07196 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFLP07196 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFLP07196 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFLP07196 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEFLP07196 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEFLP07196 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEFLP07196 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEFLP07196 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFLP07196 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms