Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1P04632 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms