Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-AP01891 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-AP01891 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms